MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 101352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009525	CCT	2	6	24083	24088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659777
502	NC_009525	TCG	2	6	24106	24111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659777
503	NC_009525	GTC	2	6	24132	24137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659777
504	NC_009525	GCA	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659777
505	NC_009525	CG	3	6	24179	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
506	NC_009525	GC	3	6	24304	24309	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
507	NC_009525	CAG	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659777
508	NC_009525	TCG	2	6	24349	24354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659777
509	NC_009525	GCCG	2	8	24402	24409	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
510	NC_009525	CCCA	2	8	24414	24421	25 %	0 %	0 %	75 %	148659777
511	NC_009525	GTT	2	6	24471	24476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659777
512	NC_009525	GC	3	6	24501	24506	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
513	NC_009525	CG	3	6	24530	24535	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
514	NC_009525	GTC	2	6	24695	24700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659778
515	NC_009525	GTC	2	6	24802	24807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659778
516	NC_009525	GTC	2	6	24826	24831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659778
517	NC_009525	GC	3	6	24833	24838	0 %	0 %	50 %	50 %	148659778
518	NC_009525	CG	3	6	24872	24877	0 %	0 %	50 %	50 %	148659778
519	NC_009525	CAC	2	6	24898	24903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659778
520	NC_009525	CG	3	6	24932	24937	0 %	0 %	50 %	50 %	148659778
521	NC_009525	CAT	2	6	24973	24978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659778
522	NC_009525	CAA	2	6	25045	25050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659778
523	NC_009525	GAT	2	6	25234	25239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659779
524	NC_009525	ATCAC	2	10	25259	25268	40 %	20 %	0 %	40 %	148659779
525	NC_009525	GTG	2	6	25310	25315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659779
526	NC_009525	TGG	2	6	25320	25325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659779
527	NC_009525	AC	3	6	25386	25391	50 %	0 %	0 %	50 %	148659779
528	NC_009525	GAT	2	6	25432	25437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659779
529	NC_009525	CGT	2	6	25476	25481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659779
530	NC_009525	CGG	2	6	25506	25511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659779
531	NC_009525	GCC	2	6	25519	25524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659779
532	NC_009525	GCTG	2	8	25553	25560	0 %	25 %	50 %	25 %	148659779
533	NC_009525	CGTAGT	2	12	25587	25598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148659779
534	NC_009525	CGGC	2	8	25601	25608	0 %	0 %	50 %	50 %	148659779
535	NC_009525	GAG	2	6	25632	25637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659779
536	NC_009525	GCC	3	9	25684	25692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659779
537	NC_009525	GCCG	2	8	25701	25708	0 %	0 %	50 %	50 %	148659779
538	NC_009525	CGGG	2	8	25776	25783	0 %	0 %	75 %	25 %	148659779
539	NC_009525	CTC	2	6	25813	25818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659779
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541	NC_009525	GCC	2	6	25870	25875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659779
542	NC_009525	GCC	2	6	25894	25899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659779
543	NC_009525	GCCGG	2	10	25946	25955	0 %	0 %	60 %	40 %	148659779
544	NC_009525	AGG	2	6	25963	25968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659779
545	NC_009525	GCG	2	6	25983	25988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659779
546	NC_009525	C	6	6	25994	25999	0 %	0 %	0 %	100 %	148659779
547	NC_009525	CCTGGT	2	12	26025	26036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659779
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549	NC_009525	C	6	6	26200	26205	0 %	0 %	0 %	100 %	148659779
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553	NC_009525	GCCCCT	2	12	26295	26306	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148659779
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555	NC_009525	CGA	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659779
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558	NC_009525	GCC	2	6	26669	26674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659779
559	NC_009525	GCA	2	6	26682	26687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659779
560	NC_009525	GC	3	6	27278	27283	0 %	0 %	50 %	50 %	148659780
561	NC_009525	CGC	2	6	27301	27306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659780
562	NC_009525	TTG	2	6	27307	27312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659780
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565	NC_009525	GCA	2	6	27407	27412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659780
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573	NC_009525	CGG	2	6	27684	27689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659780
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589	NC_009525	CAG	2	6	28471	28476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659781
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593	NC_009525	GCC	2	6	28576	28581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659781
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597	NC_009525	CGGC	2	8	28966	28973	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
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603	NC_009525	CCG	2	6	29225	29230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659783
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608	NC_009525	CCGG	2	8	29452	29459	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
609	NC_009525	CG	3	6	29491	29496	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
610	NC_009525	GC	3	6	29497	29502	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
611	NC_009525	GTC	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659783
612	NC_009525	TCGGCG	2	12	29593	29604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659783
613	NC_009525	CGA	2	6	29606	29611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659783
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621	NC_009525	GGC	2	6	29896	29901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659784
622	NC_009525	CTG	2	6	29910	29915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
623	NC_009525	TCA	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659784
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625	NC_009525	CGA	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659784
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627	NC_009525	ACC	2	6	30020	30025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659784
628	NC_009525	CGT	2	6	30068	30073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659784
629	NC_009525	GC	4	8	30085	30092	0 %	0 %	50 %	50 %	148659784
630	NC_009525	CGA	2	6	30116	30121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659784
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632	NC_009525	GGC	2	6	30139	30144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659784
633	NC_009525	TGCG	2	8	30147	30154	0 %	25 %	50 %	25 %	148659784
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641	NC_009525	ACG	2	6	30670	30675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659785
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644	NC_009525	CG	3	6	30780	30785	0 %	0 %	50 %	50 %	148659785
645	NC_009525	GGATCA	2	12	30791	30802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148659785
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650	NC_009525	ACCG	2	8	31184	31191	25 %	0 %	25 %	50 %	148659786
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742	NC_009525	GATC	2	8	36792	36799	25 %	25 %	25 %	25 %	148659792
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745	NC_009525	CGG	2	6	36968	36973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659792
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751	NC_009525	ATC	2	6	37159	37164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659792
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